1、應(yīng)用范圍不同

氣相色譜法適用于易揮發(fā)有機化合物的定性、定量分析。而氣質(zhì)聯(lián)用色譜法在環(huán)保、醫(yī)藥、農(nóng)藥和興奮劑等領(lǐng)域起著越來越重要的作用，是分離和檢測復(fù)雜化合物的蕞有力工具之一。

2、特點不同

氣-質(zhì)聯(lián)用將GC與MS聯(lián)用，即氣-質(zhì)聯(lián)用，彼此揚長避短，既彌補了GC只憑保留時間難以對復(fù)雜化合物中未知組分做出可靠的定性鑒定的缺點，又利用了鑒別能力很強且靈敏度極高的MS作為檢測器，憑借其高分辨能力、高靈敏度和分析過程簡便快速的特點。

氣相色譜法具有效能高、靈敏度高、選擇性強、分析速度快、應(yīng)用廣泛、操作簡便等特點。

3、分析過程不同

氣相色譜法，汽化的試樣被載氣（流動相）帶入色譜柱中，柱中的固定相與試樣中各組份分子作用力不同，各組份從色譜柱中流出時間不同，組份彼此分離。采用適當(dāng)?shù)蔫b別和記錄系統(tǒng)，制作標(biāo)出各組份流出色譜柱的時間和濃度的色譜圖。

根據(jù)圖中表明的出峰時間和順序，可對化合物進行定性分析；根據(jù)峰的高低和面積大小，可對化合物進行定量分析。

氣-質(zhì)聯(lián)用，混合物樣品經(jīng)色譜柱分離后進入質(zhì)譜儀離子源 ，在離子源被電離成離子，離子經(jīng)質(zhì)量分析器?、檢測器之后即成為質(zhì)譜信號并輸入計算機。樣品由色譜柱不斷地流入離子源，離子由離子源不斷進入分析器并不斷得到質(zhì)譜，只要設(shè)定好分析器掃描的質(zhì)量范圍和掃描時間，計算機就可以采集到一個個質(zhì)譜。

計算機可以自動將每個質(zhì)譜的所有離子強度相加，顯示出總離子強度，總離子強度隨時間變化的曲線就是總離子色譜圖，總離子色譜圖的形狀和普通的色譜圖是相一致的，可以認(rèn)為是用質(zhì)譜作為檢測器得到的色譜圖。